Bölgenin morfolojik yapısından, iklim ve bitki örtüsünden dolayı zengin hayvan türlerine rastlanır. Her türden sürüngenler, memeli hayvanlar ve kuşlar.
Hayvan türlerinden bazıları şunlardır; Benekli kaplumbağa, Deniz kaplumbağaları, Dikenli kertenkele, Bukalemun, Oluklu kertenkele, Boynuzlu engerek, Hazer yılanı, Mahmuzlu yılan, Vaşak, Karaca, Karageyik, Alageyik, Dağ keçisi.
Köyceğiz kuş cenneti olarakta bilinir. 180 çeşit kuş türü gözlemlenmiştir. Bunlardan en önemlileri : Yalıçapkını, Alaca Yalıçapkını, Sakarmeke.